Moxhtaba Khamenei nuk është shfaqur publikisht tre ditë pas zgjedhjes si udhëheqës suprem i Iranit. Nuk është publikuar asnjë fotografi apo video e tij, ndonëse zyrtarë iranianë kanë dhënë garanci se materiale të tilla do të shpallen së shpejti.
Gjatë kohës së luftës, masat e sigurisë janë të ashpra dhe pritet që Khamenei të kalojë shumicën e kohës në strehimore. Burime me njohuri mbi situatën, të cituara nga Jerusalem Post, thonë se ai është lënduar gjatë konfliktit, por mbetet i aftë të kryejë detyrat dhe të menaxhojë çështjet shtetërore.
Televizioni shtetëror iranian raportoi të hënën se Khamenei ka pësuar një lëndim, pa dhënë detaje mbi rrethanat apo seriozitetin e tij. Nuk specifikohet koha e lëndimit apo ndikimi në aftësinë udhëheqëse.
Mungesa nga skena publike ka nxitur diskutime. Kritikët e regjimit argumentojnë se ngre pyetje mbi atë se kush drejton vërtet qeverinë iraniane. Disa figura të opozitës besojnë se një zyrtar tjetër i lartë mund të ushtrojë realisht pushtetin, ndërsa Khamenei vepron si figurë simbolike.